Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCSTNQ92542 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NCSTNQ92542 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms