Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCFD1Q8WVM8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCFD1Q8WVM8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCFD1Q8WVM8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCFD1Q8WVM8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCFD1Q8WVM8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCFD1Q8WVM8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SCFD1Q8WVM8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCFD1Q8WVM8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCFD1Q8WVM8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCFD1Q8WVM8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCFD1Q8WVM8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCFD1Q8WVM8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SCFD1Q8WVM8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCFD1Q8WVM8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCFD1Q8WVM8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCFD1Q8WVM8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCFD1Q8WVM8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCFD1Q8WVM8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCFD1Q8WVM8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCFD1Q8WVM8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCFD1Q8WVM8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCFD1Q8WVM8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCFD1Q8WVM8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCFD1Q8WVM8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SCFD1Q8WVM8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCFD1Q8WVM8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms