Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK2

SNRNP27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP27Q8WVK2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRNP27Q8WVK2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRNP27Q8WVK2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRNP27Q8WVK2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRNP27Q8WVK2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP27Q8WVK2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP27Q8WVK2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP27Q8WVK2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP27Q8WVK2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP27Q8WVK2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP27Q8WVK2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP27Q8WVK2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP27Q8WVK2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP27Q8WVK2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRNP27Q8WVK2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP27Q8WVK2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms