Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD1

RAB2B, Ras-related protein Rab-2B, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2BQ8WUD1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB2BQ8WUD1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB2BQ8WUD1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms