Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSC4DQ8WTU2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSC4DQ8WTU2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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