Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
RB1CC1Q8TDY2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC48.07■■■■■ 5.29
RB1CC1Q8TDY2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
RB1CC1Q8TDY2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
RB1CC1Q8TDY2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC48.05■■■■■ 5.28
RB1CC1Q8TDY2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
RB1CC1Q8TDY2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
RB1CC1Q8TDY2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC48.04■■■■■ 5.28
RB1CC1Q8TDY2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
RB1CC1Q8TDY2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC48.04■■■■■ 5.28
RB1CC1Q8TDY2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
RB1CC1Q8TDY2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
RB1CC1Q8TDY2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.03■■■■■ 5.28
RB1CC1Q8TDY2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
RB1CC1Q8TDY2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.03■■■■■ 5.28
RB1CC1Q8TDY2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC48.02■■■■■ 5.28
RB1CC1Q8TDY2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC48.01■■■■■ 5.28
RB1CC1Q8TDY2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC48.01■■■■■ 5.28
RB1CC1Q8TDY2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC48■■■■■ 5.28
RB1CC1Q8TDY2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC48■■■■■ 5.28
RB1CC1Q8TDY2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC48■■■■■ 5.28
RB1CC1Q8TDY2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
RB1CC1Q8TDY2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC47.99■■■■■ 5.27
RB1CC1Q8TDY2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
RB1CC1Q8TDY2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC47.99■■■■■ 5.27
RB1CC1Q8TDY2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
RB1CC1Q8TDY2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
RB1CC1Q8TDY2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC47.97■■■■■ 5.27
RB1CC1Q8TDY2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC47.97■■■■■ 5.27
RB1CC1Q8TDY2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
RB1CC1Q8TDY2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
RB1CC1Q8TDY2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC47.96■■■■■ 5.27
RB1CC1Q8TDY2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC47.94■■■■■ 5.26
RB1CC1Q8TDY2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.26
RB1CC1Q8TDY2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.93■■■■■ 5.26
RB1CC1Q8TDY2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC47.92■■■■■ 5.26
RB1CC1Q8TDY2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC47.92■■■■■ 5.26
RB1CC1Q8TDY2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC47.92■■■■■ 5.26
RB1CC1Q8TDY2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC47.92■■■■■ 5.26
RB1CC1Q8TDY2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
RB1CC1Q8TDY2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
RB1CC1Q8TDY2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC47.91■■■■■ 5.26
RB1CC1Q8TDY2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
RB1CC1Q8TDY2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
RB1CC1Q8TDY2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC47.9■■■■■ 5.26
RB1CC1Q8TDY2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
RB1CC1Q8TDY2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC47.89■■■■■ 5.26
RB1CC1Q8TDY2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
RB1CC1Q8TDY2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC47.88■■■■■ 5.26
RB1CC1Q8TDY2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.88■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC47.88■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC47.88■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC47.88■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC47.88■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC47.87■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC47.86■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC47.86■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC47.85■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC47.84■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC47.84■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC47.84■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC47.84■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC47.83■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC47.83■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC47.83■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC47.83■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
RB1CC1Q8TDY2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.81■■■■■ 5.24
RB1CC1Q8TDY2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC47.81■■■■■ 5.24
RB1CC1Q8TDY2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC47.81■■■■■ 5.24
RB1CC1Q8TDY2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
RB1CC1Q8TDY2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
RB1CC1Q8TDY2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC47.8■■■■■ 5.24
RB1CC1Q8TDY2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC47.8■■■■■ 5.24
RB1CC1Q8TDY2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC47.8■■■■■ 5.24
RB1CC1Q8TDY2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC47.8■■■■■ 5.24
RB1CC1Q8TDY2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC47.8■■■■■ 5.24
RB1CC1Q8TDY2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
RB1CC1Q8TDY2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC47.79■■■■■ 5.24
RB1CC1Q8TDY2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
RB1CC1Q8TDY2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
RB1CC1Q8TDY2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
RB1CC1Q8TDY2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
RB1CC1Q8TDY2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC47.78■■■■■ 5.24
RB1CC1Q8TDY2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC47.78■■■■■ 5.24
RB1CC1Q8TDY2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC47.78■■■■■ 5.24
RB1CC1Q8TDY2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC47.77■■■■■ 5.24
RB1CC1Q8TDY2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC47.77■■■■■ 5.24
RB1CC1Q8TDY2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
RB1CC1Q8TDY2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms