Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R17PQ8TDU5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R17PQ8TDU5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R17PQ8TDU5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R17PQ8TDU5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R17PQ8TDU5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R17PQ8TDU5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R17PQ8TDU5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R17PQ8TDU5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R17PQ8TDU5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R17PQ8TDU5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R17PQ8TDU5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R17PQ8TDU5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R17PQ8TDU5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R17PQ8TDU5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R17PQ8TDU5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R17PQ8TDU5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R17PQ8TDU5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R17PQ8TDU5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R17PQ8TDU5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R17PQ8TDU5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VN1R17PQ8TDU5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VN1R17PQ8TDU5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms