Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM71BQ8TC56 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM71BQ8TC56 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FAM71BQ8TC56 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM71BQ8TC56 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms