Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNIH3Q8TBE1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNIH3Q8TBE1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms