Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9orf43Q8TAL5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf43Q8TAL5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms