Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP61Q8NHU2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP61Q8NHU2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms