Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUP35Q8NFH5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP35Q8NFH5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP35Q8NFH5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.5 ms