Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY8

PPHLN1, Periphilin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPHLN1Q8NEY8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPHLN1Q8NEY8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPHLN1Q8NEY8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPHLN1Q8NEY8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPHLN1Q8NEY8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPHLN1Q8NEY8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPHLN1Q8NEY8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPHLN1Q8NEY8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPHLN1Q8NEY8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPHLN1Q8NEY8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPHLN1Q8NEY8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms