Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPFIBP2Q8ND30 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPFIBP2Q8ND30 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms