Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAMD12Q8N8I0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMD12Q8N8I0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD12Q8N8I0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms