Protein–RNA interactions for Protein: Q8N468

MFSD4A, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD4AQ8N468 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD4AQ8N468 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD4AQ8N468 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD4AQ8N468 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD4AQ8N468 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD4AQ8N468 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD4AQ8N468 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD4AQ8N468 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD4AQ8N468 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD4AQ8N468 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms