Protein–RNA interactions for Protein: Q8N370

SLC43A2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A2Q8N370 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A2Q8N370 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A2Q8N370 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A2Q8N370 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A2Q8N370 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A2Q8N370 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A2Q8N370 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A2Q8N370 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A2Q8N370 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A2Q8N370 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A2Q8N370 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A2Q8N370 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A2Q8N370 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC43A2Q8N370 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC43A2Q8N370 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC43A2Q8N370 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC43A2Q8N370 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC43A2Q8N370 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC43A2Q8N370 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC43A2Q8N370 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC43A2Q8N370 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC43A2Q8N370 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC43A2Q8N370 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC43A2Q8N370 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC43A2Q8N370 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A2Q8N370 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A2Q8N370 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A2Q8N370 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A2Q8N370 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A2Q8N370 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC43A2Q8N370 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC43A2Q8N370 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC43A2Q8N370 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms