Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2K1

UBE2J2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J2Q8N2K1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2J2Q8N2K1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2J2Q8N2K1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2J2Q8N2K1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms