Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00269Q8N2A0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00269Q8N2A0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms