Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00518Q8N0U6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00518Q8N0U6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00518Q8N0U6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00518Q8N0U6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00518Q8N0U6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00518Q8N0U6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00518Q8N0U6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00518Q8N0U6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00518Q8N0U6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00518Q8N0U6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00518Q8N0U6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00518Q8N0U6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms