Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL3Q8IVW4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDKL3Q8IVW4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKL3Q8IVW4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms