Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD5

LDLRAD3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD3Q86YD5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LDLRAD3Q86YD5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LDLRAD3Q86YD5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LDLRAD3Q86YD5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LDLRAD3Q86YD5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LDLRAD3Q86YD5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LDLRAD3Q86YD5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LDLRAD3Q86YD5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LDLRAD3Q86YD5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LDLRAD3Q86YD5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LDLRAD3Q86YD5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LDLRAD3Q86YD5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LDLRAD3Q86YD5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LDLRAD3Q86YD5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LDLRAD3Q86YD5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LDLRAD3Q86YD5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LDLRAD3Q86YD5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LDLRAD3Q86YD5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LDLRAD3Q86YD5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LDLRAD3Q86YD5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LDLRAD3Q86YD5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LDLRAD3Q86YD5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAD3Q86YD5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 378 ms