Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LCA5Q86VQ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 917 ms