Protein–RNA interactions for Protein: Q86U17

SERPINA11, Serpin A11, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA11Q86U17 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINA11Q86U17 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINA11Q86U17 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINA11Q86U17 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINA11Q86U17 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINA11Q86U17 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINA11Q86U17 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINA11Q86U17 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINA11Q86U17 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINA11Q86U17 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINA11Q86U17 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINA11Q86U17 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINA11Q86U17 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINA11Q86U17 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINA11Q86U17 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINA11Q86U17 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINA11Q86U17 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINA11Q86U17 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINA11Q86U17 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SERPINA11Q86U17 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms