Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z794

KRT77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT77Q7Z794 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT77Q7Z794 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KRT77Q7Z794 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT77Q7Z794 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT77Q7Z794 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT77Q7Z794 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT77Q7Z794 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT77Q7Z794 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT77Q7Z794 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT77Q7Z794 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT77Q7Z794 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT77Q7Z794 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT77Q7Z794 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT77Q7Z794 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT77Q7Z794 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT77Q7Z794 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT77Q7Z794 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms