Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A3Q7Z3Q1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC46A3Q7Z3Q1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms