Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
APTXQ7Z2E3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
APTXQ7Z2E3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
APTXQ7Z2E3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms