Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
STRADAQ7RTN6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
STRADAQ7RTN6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRADAQ7RTN6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms