Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf47Q6ZRZ4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf47Q6ZRZ4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms