Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTL4Q6ZR62 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTL4Q6ZR62 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTL4Q6ZR62 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.8 ms