Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNA4

RNF111, E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF111Q6ZNA4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF111Q6ZNA4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF111Q6ZNA4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF111Q6ZNA4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF111Q6ZNA4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms