Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW02

CYP20A1, Cytochrome P450 20A1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP20A1Q6UW02 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP20A1Q6UW02 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP20A1Q6UW02 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP20A1Q6UW02 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP20A1Q6UW02 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP20A1Q6UW02 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP20A1Q6UW02 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP20A1Q6UW02 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP20A1Q6UW02 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP20A1Q6UW02 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP20A1Q6UW02 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP20A1Q6UW02 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP20A1Q6UW02 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP20A1Q6UW02 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP20A1Q6UW02 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP20A1Q6UW02 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP20A1Q6UW02 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYP20A1Q6UW02 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP20A1Q6UW02 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms