Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CASC1Q6TDU7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CASC1Q6TDU7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CASC1Q6TDU7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CASC1Q6TDU7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CASC1Q6TDU7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CASC1Q6TDU7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CASC1Q6TDU7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CASC1Q6TDU7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CASC1Q6TDU7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CASC1Q6TDU7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CASC1Q6TDU7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CASC1Q6TDU7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CASC1Q6TDU7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CASC1Q6TDU7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CASC1Q6TDU7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CASC1Q6TDU7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms