Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC174Q6PII3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC174Q6PII3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC174Q6PII3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC174Q6PII3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC174Q6PII3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC174Q6PII3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC174Q6PII3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC174Q6PII3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC174Q6PII3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC174Q6PII3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC174Q6PII3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC174Q6PII3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC174Q6PII3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC174Q6PII3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC174Q6PII3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC174Q6PII3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC174Q6PII3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC174Q6PII3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC174Q6PII3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC174Q6PII3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC174Q6PII3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC174Q6PII3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms