Protein–RNA interactions for Protein: Q6P499

NIPAL3, NIPA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL3Q6P499 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIPAL3Q6P499 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPAL3Q6P499 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPAL3Q6P499 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms