Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6P435 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6P435 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6P435 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6P435 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q6P435 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q6P435 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q6P435 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q6P435 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q6P435 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q6P435 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q6P435 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Q6P435 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q6P435 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q6P435 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q6P435 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q6P435 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q6P435 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q6P435 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q6P435 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q6P435 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q6P435 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q6P435 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q6P435 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q6P435 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q6P435 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Q6P435 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q6P435 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q6P435 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q6P435 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q6P435 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q6P435 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q6P435 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6P435 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6P435 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6P435 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6P435 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6P435 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6P435 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6P435 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q6P435 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q6P435 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q6P435 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q6P435 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6P435 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6P435 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6P435 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6P435 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q6P435 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6P435 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6P435 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6P435 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6P435 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6P435 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6P435 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6P435 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q6P435 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6P435 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6P435 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6P435 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6P435 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6P435 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6P435 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6P435 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6P435 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6P435 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6P435 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6P435 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6P435 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6P435 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6P435 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6P435 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q6P435 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6P435 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6P435 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6P435 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q6P435 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6P435 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6P435 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6P435 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6P435 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6P435 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6P435 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q6P435 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6P435 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6P435 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6P435 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6P435 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6P435 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q6P435 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q6P435 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q6P435 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q6P435 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q6P435 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P435 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P435 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P435 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P435 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P435 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P435 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms