Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF544Q6NX49 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZNF544Q6NX49 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms