Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGMBQ6NW40 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGMBQ6NW40 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGMBQ6NW40 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGMBQ6NW40 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGMBQ6NW40 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGMBQ6NW40 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RGMBQ6NW40 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RGMBQ6NW40 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RGMBQ6NW40 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGMBQ6NW40 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGMBQ6NW40 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGMBQ6NW40 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGMBQ6NW40 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGMBQ6NW40 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGMBQ6NW40 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGMBQ6NW40 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RGMBQ6NW40 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGMBQ6NW40 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGMBQ6NW40 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGMBQ6NW40 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGMBQ6NW40 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGMBQ6NW40 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RGMBQ6NW40 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms