Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ANKRD40Q6AI12 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ANKRD40Q6AI12 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ANKRD40Q6AI12 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms