Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD16Q68DU8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD16Q68DU8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD16Q68DU8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCTD16Q68DU8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCTD16Q68DU8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCTD16Q68DU8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCTD16Q68DU8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCTD16Q68DU8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD16Q68DU8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCTD16Q68DU8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD16Q68DU8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD16Q68DU8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD16Q68DU8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD16Q68DU8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD16Q68DU8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD16Q68DU8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD16Q68DU8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD16Q68DU8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD16Q68DU8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD16Q68DU8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD16Q68DU8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD16Q68DU8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD16Q68DU8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD16Q68DU8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms