Protein–RNA interactions for Protein: Q643R3

LPCAT4, Lysophospholipid acyltransferase LPCAT4, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT4Q643R3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LPCAT4Q643R3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT4Q643R3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms