Protein–RNA interactions for Protein: Q5W5X9

TTC23, Tetratricopeptide repeat protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC23Q5W5X9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC23Q5W5X9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC23Q5W5X9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC23Q5W5X9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms