Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF220Q5VTB9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF220Q5VTB9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF220Q5VTB9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms