Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC122Q5T0U0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC122Q5T0U0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms