Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAPCD1Q5SSQ6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms