Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WASHC2DQ5SRD0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WASHC2DQ5SRD0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WASHC2DQ5SRD0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WASHC2DQ5SRD0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WASHC2DQ5SRD0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WASHC2DQ5SRD0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WASHC2DQ5SRD0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WASHC2DQ5SRD0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WASHC2DQ5SRD0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WASHC2DQ5SRD0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WASHC2DQ5SRD0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WASHC2DQ5SRD0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WASHC2DQ5SRD0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WASHC2DQ5SRD0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WASHC2DQ5SRD0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WASHC2DQ5SRD0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WASHC2DQ5SRD0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WASHC2DQ5SRD0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
WASHC2DQ5SRD0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WASHC2DQ5SRD0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WASHC2DQ5SRD0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WASHC2DQ5SRD0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
WASHC2DQ5SRD0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WASHC2DQ5SRD0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms