Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCID2Q5JVF3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCID2Q5JVF3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCID2Q5JVF3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCID2Q5JVF3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCID2Q5JVF3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCID2Q5JVF3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCID2Q5JVF3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCID2Q5JVF3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCID2Q5JVF3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCID2Q5JVF3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PCID2Q5JVF3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCID2Q5JVF3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCID2Q5JVF3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCID2Q5JVF3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCID2Q5JVF3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCID2Q5JVF3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCID2Q5JVF3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCID2Q5JVF3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCID2Q5JVF3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCID2Q5JVF3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCID2Q5JVF3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCID2Q5JVF3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCID2Q5JVF3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCID2Q5JVF3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCID2Q5JVF3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCID2Q5JVF3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCID2Q5JVF3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCID2Q5JVF3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 409.1 ms