Protein–RNA interactions for Protein: Q4W5G0

TIGD2, Tigger transposable element-derived protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD2Q4W5G0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIGD2Q4W5G0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIGD2Q4W5G0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIGD2Q4W5G0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms