Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBRG1Q3YBR2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TBRG1Q3YBR2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms