Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00303Q3SY05 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00303Q3SY05 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00303Q3SY05 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00303Q3SY05 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms